FBI Assistant Director Walter Skinner is the prime suspect in a homicide involving a woman he was with the night of her death. Mulder and Scully are all he has to prove his innocence, as superior officers try to shut him down and the only clue is a mysterious old woman.

Mulder在医院被Fowley监管着。他想办法请来了Skinner和Kritschgau来帮忙，他们了解到Mulder拥有了CIA一直在研究的读心术。Scully在象牙海岸寻找治愈Mulder的办法。Mulder的病情加重了。

在电影FTF里出现的变种alien从一个基因技术研究公司的员工肚子里钻出来逃跑了。Mulder和Scully找到了Gibson，他带Mulder去找那个alien。Scully证明出Gibson可能是外星人（所有人类都可能是）。X档案现在由Spender和Fowley主管。Gibson最后又不见了。

美国FBI探员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）童年时曾经历一起离奇神秘的绑架案，他的妹妹萨曼莎在睡梦中被外星人劫持，至今下落不明。从此穆德便专注于神秘事件的研究，并专门负责FBI总部的X档案部门。因穆德行事乖张，难以驾驭。FBI高层从联邦调查局学院调来女性探员黛娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰），表面上是协助穆德工作，实际上是希望这名崇尚科学的理性探员能够制约穆德的行为。两人最初的合作并不理想，完全不同的思维模式时刻导致争论的爆发。但随着各种离奇案件的出现以及两人交往的加深，穆德和斯科莉最终变成可以为对方出生入死的可靠伙伴……　　本片荣获1996~1999年度美国作曲家、作家及出版商协会影视音乐奖电视剧集第一名以及其他电影节近70个奖项。

继续延续上一季的剧情，原来穆德受了骗，及时发觉错误后和史考莉串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为一个普通FBI特别探员不该进入的地方”搜集需要的资料。本季发展越来越精彩，一些没有被完全改造的混血外星人联合起来抵抗殖民阴谋。史考莉被绑架时子宫被移除，但今年却出现了她的孩子——艾蜜莉。今年制作小组甚至找了两位知名科幻小说家操笔，客串写出两集剧本。另外今年也有一集喜剧。整出X档案为了配合电影的上映，加入了一些角色及内容，“辛迪加”组织的阴谋越来越明显，穆德再一次接近事实的真相。穆德前女友的出现也对穆德与史考莉间的关系做出重大考验。该季结束于吸烟人烧毁了所有X档案卷宗。

The continuing search for Jeremiah Smith leads Scully to uncover encrypted data files whose purpose is not yet known. Being closely hunted by an unknown assassin, Jeremiah leads Mulder to a secluded farm in rural Canada while men in suits determine Mrs. Mulder's fate.

据福斯电视部门老大加里·纽曼透露，新一季《X档案》可能因主演档期问题，延后至2018年底或2019年播出。但有望由上季的6集扩充至10集。作为经典剧集，《X档案》一直有着一批忠实粉丝。 即使在停播了14年后，于2016年初播出了全新的故事，首集便吸引到1350万观众收看。

改编自著名经典小说，故事描述一个小女孩，如何排除万难和种种考验，为自己争取关爱、认同和专属的一席之地。故事发生于 19世纪后期，孤女安妮（艾米贝丝·麦克纳尔蒂 Amybeth McNulty 饰）经历了在孤儿院和陌生人家中饱受虐待的童年后，意外被安排到爱德华王子岛上一对兄妹的家中生活。随著时间流逝，年仅13岁的安妮凭著她的独特魄力、智慧和丰富的想像力，为玛莉拉·卡斯柏特（杰拉丁妮·詹姆斯 Geraldine James 饰）和马修·卡斯柏特（罗伯特·H·托马斯 R.H. Thomson 饰）的生活，甚至整个小镇带来改变。安妮的经历将为自我认同、女性主义、霸凌和偏见等恒久议题带来反思。

故事发生在英格兰西南部的多塞特郡一个安宁的海滨小镇Broadchurch。满身血污的Danny Latimer的尸体被发现在一片风景宁静的海滩上。这座安逸的滨海小镇因此被推上了风口浪尖，不仅引来了居民们的惊恐，还招致媒体的疯狂报道。新获得提升的侦探巡官Alec Hardy（大卫·田纳特 David Tennant 饰）被调到这座小镇任职。因为此举抢了本属于当地女侦探Ellie Miller（奥莉薇娅·柯尔曼 Olivia Colman 饰）的职位，因而遭到她的敌视。面对这起意外死亡，两人不得不联手共同调查。高耸陡峭的岩石峭壁环抱四周，人们怀疑Danny是从上面失足落下的。他的死因仍扑朔迷离，而他所在的这个风景如画的海滨小镇成了警察调查的中心，媒体汇集的焦点。而这份不和谐的喧闹则成为了分裂社区的威胁……

ITV称第三季将于2017年2月27日（英国时间）回归，且会有一些新角色加入，并且第三季将是最终季。　　第三季中Hardy警长和Miller警长再次联手，而Danny之死似乎永远也无法划下句号。作为最终季，第三季将关注于这一事件给涉及到的每个人带来的情感伤害，以及对友谊、亲情不可挽回的损伤。