故事发生在清朝，又一批新的秀女从地方推荐到京城参加选举了，其中包括湖广总督的女儿侯佳玉莹（黎姿 饰）、出身上三旗的尔淳（佘诗曼 饰）等名门望族的女儿。岂料，半路运送这些秀女的官车遭到山贼打劫，官兵都被山贼杀害，眼看这些秀女就要落入山贼手中。这时，运送贡品香芒上京的孔武（陈豪 饰）和陈爽路过，将秀女救下。随后，他们历尽艰苦躲过追杀，终于将秀女安全护送到京。　　侯佳玉莹和尔淳在逃亡时结为金兰，其实两人暗里却各有所谋，尔淳和她的两个姊妹将玉莹视为最大劲敌，千方百计排挤她，让她吃尽苦头；玉莹表面上处于下锋，楚楚可怜，却内心通透，自有手段。二人设法博取皇上欢心，而尔淳也在纷争中尽力掩埋着自己背后的秘密，岂料，太医孙白杨（林保怡 饰）的出现，却令玉莹和尔淳的计划都横生了枝节，后宫斗争进一步变得步步凶险。

嘉庆年间，皇上与皇后前往热河行宫避暑，并许诺归来后将于中秋佳节之季晋如妃（邓萃雯饰）为贵妃。然而此时宫外却疯传对如妃不利的传言，靠在宫中打听消息取利的撷芳殿奶娘湘菱（蔡少芬 饰）和公公马新满（韦家雄 饰）等人亦卷入其中。而这一切却是如妃的妹妹，也就是年少守寡的淳太妃（伍咏薇 饰）所为。如妃听之任之，只愿有朝一日能解开心结。并暗中笼络亲生孩儿五阿哥的奶娘湘菱和太医杨梓轩（曹永廉 饰）一齐照顾五阿哥，以保守钮祜禄一族的秘密。为讨淳太妃欢心，如妃要求南府在戏单上加唱一曲《牡丹亭》。手忙脚乱之际，公公马新满只得让在府中教戏的章和班代为上台。却不料京中名伶高流斐（陈豪 饰）一唱成名，宫中女子多芳心暗许，如一粒石子投入紫禁城平静的湖心。　　本剧为《金枝欲孽》第二部，讲述另一个时空的后宫风云。

阿纯（林家栋 饰）是村里有名的“野孩子”，母亲疯疯癫癫，父亲不知所踪。大酒坊“九铺香”的当家古世龙（秦沛 饰）可怜阿纯坎坷的遭遇，收留了他，为了报答古世龙的救命之恩，阿纯在酒坊之中尽心尽责，勤勤恳恳，但却因为不光彩的身世而饱受欺凌和非议。　　古世龙是个彻头彻尾的精明商人，和哥哥古世熊之间的关系十分紧张，两人明争暗斗，不分上下，妹妹古瑶（邓萃雯 饰）自小看透了坊内的风风雨雨尔虞我诈，对这一切厌倦至极。一场不期而至的风波波及了酒坊，古世龙尝尽了背叛的滋味，唯有阿纯和善良的黎顺风（佘诗曼 饰）不离不弃的守候在他的身边，于是，古世龙做出了一个惊人的决定，那就是将人人觊觎的酒坊当家之位交给顺风。

一宗枪杀案，便衣沙展高力基(罗仲谦饰)遇上「木独」又「棘手」的目击証人李浩帆(韦家雄饰)。力基被指派贴身保护浩帆，两人由陌生与抗拒，渐渐接受对方。此时，由浩帆做大股东的成衣公司被发现卷入犯罪交易，公司高层叶长乐(刘江饰)、叶明钧(徐荣饰)父子牵涉其中。力基联同浩帆，以及其任职大律师的妹妹李颂盈(张曦雯饰)合力追查，期间力基、颂盈产生纠缠不清的感情，力基的姊姊高咏音(张文慈饰)亦与浩帆成为斗气冤家。命运将四人拉在一起，而一宗廿多年前的悬案，也因此再次掀开序幕……

在民国初年，在偏僻落后的村落 — 平安谷内，男尊女卑的封建思想下，女人一直被男人欺压。一对受了西方思想熏陶的夫妻，返回平安谷，想改变、建设家乡，可惜遇到新旧思想的冲击，困难重重，还被卷入神秘的幽灵新娘杀人事件、绑架及凶杀案中，原来背后有一班被男权压迫、欺凌的女子，她们暗中结盟，进行复仇行动。

一代当红女星缪妙自下嫁前武师洪十一便息影，过着相夫教子的平凡生活，一对儿女翊岚、翊风长大后各自组织家庭。两夫妇逍遥过活，可是妙不幸患上顽疾，自知命不久已，最大心愿是“再飞一次”。奈何一当年意外受伤，轻功大不如前，正当踌躇如何带妙再飞之际，妙却不敌病魔离世。　　有心人有意为妙举办回顾展，街坊齐心和应，更落力找回一些当年他们在电影公司工作时保存下来的旧物。一本打算放弃重练轻功，手执照片一刻却百感交集，遂打算圆亡妻遗愿，定必要“再飞一次”！　　与此同时，曾在电影中担当妙替身的何索突然出现，打算向一进行报复……

一代当红女星缪妙自下嫁前武师洪十一便息影，过着相夫教子的平凡生活，一对儿女翊岚、翊风长大后各自组织家庭。两夫妇逍遥过活，可是妙不幸患上顽疾，自知命不久已，最大心愿是“再飞一次”。奈何一当年意外受伤，轻功大不如前，正当踌躇如何带妙再飞之际，妙却不敌病魔离世。　　有心人有意为妙举办回顾展，街坊齐心和应，更落力找回一些当年他们在电影公司工作时保存下来的旧物。一本打算放弃重练轻功，手执照片一刻却百感交集，遂打算圆亡妻遗愿，定必要“再飞一次”！　　与此同时，曾在电影中担当妙替身的何索突然出现，打算向一进行报复……

查向善（江美仪 饰）是一名全职母亲，看着两个可爱的女儿渐渐长大，对她们从生活到学习都严加管教，生怕一点疏忽造成不可挽回之错。无奈大女儿严茜瑜（江嘉敏 饰）并不明白母亲的一片苦心，压抑之中和母亲的关系十分紧张，父亲严夏（黄智贤 饰）又遭遇中年危机，最终夫妻两人感情破裂，虽然仍然住在同一屋檐下，却有名无实。　　那边厢，查向善和家教会的另一名母亲袁圆（吕慧仪 饰）之间亦保持着针锋相对的关系，互相视对方为眼中钉肉中刺，所幸得到训导主任文嘉熙（陈敏之 饰）从中调解，方才化干戈为玉帛。然而，查向善发现严茜瑜竟然和文嘉熙的弟弟文亮熙（何广沛 饰）情投意合，她暗中和文嘉熙联手，希望拆散这对鸳鸯。

故事发生在三十年代的香港，贪官污吏横行，拐卖案件频发。某日，梁芯（杨怡 饰）前往警局报案，遇见了名为金华（张继聪 饰）的杂差，梁芯深知警局内见钱眼开的歪风邪气，自然没有将破案的指望托付在金华身上。之后，梁芯遇见了警察沉一然（杨明 饰），和其他警探不同，沉一然年轻有为正直勇敢，在他的帮助下，人贩最终落入法网。　　梁芯和沉一然之间产生了真挚的感情，然而梁芯身份特殊，自知无法名正言顺的和沉一然走到一起，于是选择将这份感情埋藏在心底。早已经爱上梁芯的金华将这一切看在眼里，为了成全所爱之人，他忍痛出面调解，最终顺利的将梁芯和沉一然撮合到了一起。

俊（谢霆锋 饰）热爱柔道没，在外国留学的他因为姐姐珊（梁艺玲 饰）结婚回到香港，因而认识了柔道高手彬（元华 饰）。彬的身手让俊着迷，想拜彬为师却遭到姐姐的反对，原因是彬意外破坏了珊的婚事。无奈，彬只好派自己的妹妹晶晶（张燊悦 饰）教导俊。晶晶的苛刻让俊十分吃不消，俊竟决定假意追求晶晶，好让她传授自己绝技。　　另一边厢，俊极力撮合了彬与珊，两人也相恋了。正当俊以为一切都发展顺利之际，一次与同门师兄亮（刘恺威 饰）较量时被打败，同时晶晶也发现了俊的假情意。原本就喜欢晶晶的亮在这时候乘虚而入，俊却发现自己爱上了晶晶……