人類と怪獣との長い戦いは終結し、平和が訪れた。そんな時代に、怪獣の魂を宿し、怪獣の姿に変身できる少女“怪獣娘”たちが現れる。彼女たちを集めて結成された特別組織“ＧＩＲＬＳ”に、新人としてアギラ、ミクラス、ウインダムの3人が配備されることに。立派な怪獣娘になるべく訓練を受けるデコボコトリオの明日はどっちだ……! ショートアニメ『怪獣娘（かいじゅうがーるず）』は、怪獣娘たちによる笑いあり涙ありバトルありのドタバタコメディ。

『Reゼロから始める休憩時間』（リ・ゼロからはじめるブレイクタイム）および『Reぷち Reプチから始める異世界生活』（りぷち）は、AT-Xで本編終了後に放送された短編アニメ。『Reゼロから始める休憩時間』は本編で尺や展開の都合から触れることのできなかった事柄や設定を補足する内容が多い。『Reぷち』は本編とは関係がないスピンオフアニメとなる。